
En tiempos prehispánicos, el territorio de la actual Villahermosa estaba ocupado principalmente por habitantes de la etnia Yokot’an, pueblo maya con significativa presencia en la zona de Tamulté de las Sabanas, Tamulté de las Barrancas y Atasta.
En marzo de 1519 se llevó a cabo la Batalla de Centla, en la que triunfaron los españoles, fundando la ciudad de Santa María de la Victoria, en la desembocadura del Río Grijalva, frente a lo que hoy es la ciudad y puerto de Frontera.

Posteriormente, a causa de enfermedades, por encontrarse asentados en una zona pantanosa, y por el acoso de los piratas ingleses, la mayoría de los habitantes se desplazan de Santa María de la Victoria (primer asentamiento español en el territorio fundado en marzo de 1519) hacia un espacio más seguro tierra adentro, fundando una nueva población con el nombre de San Juan Bautista de Tabasco.
Cronología
1564: Tradicionalmente se ha considerado que en este año el gobernador de Yucatán, Diego de Quijada, realizó el trazado del primer cuadro de la ciudad a la que denominó Villa Carmona.
1596: Según el presbítero Manuel Gil y Sáenz, el rey de España, Felipe II, aprobó la fundación de la ciudad denominándola Villa Hermosa de San Juan Bautista.
1641: El 6 de junio de este año, se autoriza legalmente el traslado de los poderes de la provincia de Santa María de la Victoria a San Juan Bautista de Villahermosa.
1677: La ciudad fue atacada y saqueada por piratas, dando lugar a que la sede del gobierno virreinal fuera Tacotalpa más de un siglo.
1717: Con el desalojo de los piratas de la Isla del Carmen, San Juan Bautista de Villahermosa recobró importancia geográfica estratégica.
1795: Fue reinstalada la capital de Tabasco en el puerto de Villahermosa.
1809: Inició funciones el primer Ayuntamiento de San Juan de Villahermosa.
1821: Juan N. Fernández y Mantecón, proclama la Independencia en la ciudad de San Juan Bautista, provincia de Tabasco.
1826: Se decreta que la capital de Tabasco tenga el rango de ciudad, con el nombre de San Juan Bautista.
1846: El coronel Juan Bautista Traconis, encabeza la resistencia de los habitantes de San Juan Bautista que logran expulsar a los invasores estadounidenses el 25 de octubre de ese año
1847: La capital de Tabasco sufrió el acoso y ocupación de los invasores norteamericanos.
1863: La ciudad fue ocupada por las fuerzas del ejército francés.
1864: El 27 de febrero de ese año triunfan los liberales tabasqueños sobre el ejército invasor francés, fecha cívica de gran importancia pare el pueblo de Tabasco.
1879: Fundación del Instituto Juárez.
1890: Con la Constitución Política del Estado del 1 de agosto de 1890, se dio el cambio de nombre de la municipalidad de San Juan Bautista por el de Centro.
1896: Inauguración del Palacio de Gobierno.
1904: Fundación de la Escuela Normal para Profesoras
1910: Construcción del Parque de La Paz y el Parque Hidalgo.
1916: La ciudad de San Juan Bautista, pasa a nombrarse Villahermosa, por medio del decreto 111 del gobernador Francisco J. Mújica.
1925: Se concede a la mujer el derecho a votar y ser votada en los comicios electorales para Ayuntamiento.
1929: La Compañía Mexicana de Aviación inauguró la ruta México-Veracruz-Villahermosa-Mérida.
1932: La Compañía Aeronáutica del Sur inició un servicio aéreo interestatal que comunicaba a todas las cabeceras municipales.
1944: Se inaugura la biblioteca pública “José Martí”.
1958: Inauguración de la carretera Circuito del Golfo y apertura del Parque-Museo La Venta con piezas arqueológica de la cultura olmeca.
1961: El gobernador Carlos A. Madrazo, inaugura la estatua ecuestre del coronel Gregorio Méndez Magaña en Paseo Tabasco.
1962: Se apertura el mercado público municipal “José Ma. Pino Suárez”.
1964: Se inaugura el Parque de Beisbol “Centenario 27 de febrero”.
1979: Abre sus puertas el Aeropuerto Internacional Carlos Rovirosa Pérez, en la comunidad de Dos Montes.
1980: La legislatura estatal creó la Comisión para el Desarrollo Urbano Tabasco 2000.
1982: Traslado del gobierno municipal de Centro desde su antigua sede (frente al Parque Juárez) a su actual ubicación en Tabasco 2000.
1985: Se reinaugura el espacio de recreación ahora conocido como Parque Tomás Garrido Canabal
2024: Se inaugura el nuevo Malecón de Villahermosa.
2025: Inauguración de la Captación Carrizal II, Acueducto Usumacinta y Planta Potabilizadora Carrizal II.
Hoy, Villahermosa conserva su grandeza y esencia, naturaleza y presencia únicas.
Lagunas, pantanos y humedales, enmarcan la imagen de Villahermosa, con espléndidos parques, una extraordinaria biodiversidad, arquitectura que va mucho más allá del siglo pasado, y modernas edificaciones de una metrópoli que muestra una gran dinámica de negocios, comercio y otros servicios.